Doktorand i medicinsk teknik inom deep learning för medicinska bilder
Datadriven livsvetenskap (DDLS) använder data, beräkningsmetoder och artificiell intelligens för att studera biologiska system och processer på alla nivåer, från molekylära strukturer och cellulära processer till människans hälsa och de globala ekosystemen. SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS) har som mål att rekrytera och utbilda nästa generations forskare inom datadriven livsvetenskap och skapa globalt ledande kompetens inom beräknings- och datavetenskap för livsvetenskap i Sverige. Programmet har 3,3 miljarder SEK i finansiering under 12 år från Knut och Alice Wallenbergs stiftelse.
Under 2026 kommer DDLS forskarskola att rekrytera 25 akademiska- och 7 industridoktorander. Under programmets gång kommer mer än 260 doktorander och 200 postdoktorer att vara en del av forskarskolan. DDLS-programmet har fyra strategiska forskningsområden: Datadriven precisionsmedicin och diagnostik, Datadriven smittspridning och infektionsbiologi, Datadriven cell- och molekylärbiologi samt Datadriven evolution och biodiversitet. För mer information, se https://www.scilifelab.se/data-driven/ddls-research-school/ .
Livsvetenskapens framtid är datadriven. Kommer du att leda den förändringen med oss? Ansök nu!
Till Linköpings Universitet söker vi en doktorand inom** _Datadriven precisionsmedicin och diagnostik _**
Datadriven precisionsmedicin och diagnostik omfattar dataintegration, analys, visualisering och datatolkning för patientstratifiering, upptäckt av biomarkörer för sjukdomsrisker, diagnos, läkemedelsrespons och övervakning av hälsa. Forskning inom precisionsmedicin förväntas använda befintliga starka tillgångar i Sverige och utomlands, såsom molekylära data (t.ex. omics), avbildningstekniker, elektroniska hälso- och sjukvårdsdata, longitudinella patient- och befolkningsregister och biobanker.
**Dina arbetsuppgifter
**
Tjänsten handlar om att utveckla metoder för tidig upptäckt av lungcancer, genom att kombinera CT-volymer och kliniska variabler. Inom projektet SCAPIS har medicinska bilder och kliniska variabler samlats in för mer än 30,000 försökspersoner. Målet är att använda detta dataset för att träna modeller att tidigt upptäcka lungcancer (lungnoduler), och också avgöra om dessa lungnoduler är godartade eller maligna. Eftersom CT-volymer är väldigt högupplösta krävs nya effektiva metoder för att hitta alla lungnoduler. Genom att kombinera CT-volymer och kliniska variabler (t.ex. ålder, kön, om personen röker eller inte) är målet att göra metoderna ännu bättre på att skilja på godartade och maligna noduler. Du kommer att bli en expert på analys av stora medicinska dataset, och också lära dig hur AI kan användas inom sjukvården.
Anställningen innebär många olika typer av möten med andra doktorander, forskare, handledare och samarbetspartners. Du förutsätts därför kunna delta i diskussioner och föra resonemang kring frågor som rör ditt uppdrag.
Som doktorand ägnar du dig åt din forskarutbildning och forskningsprojekt där du ingår. I ditt arbete kan även ingå att undervisa eller att delta i andra institutionsuppdrag, upp till 20 procent av heltid. I arbetsuppgifterna ingår även att aktivt bidra till det samarbete inom vilket projektet kommer genomföras (läs mer under "Din arbetsplats" nedan).
Som doktorand ägnar du dig åt din forskarutbildning och forskningsprojekt där du ingår. I ditt arbete kan även ingå att undervisa eller att delta i andra institutionsuppdrag, upp till 20 procent av heltid.
**Dina kvalifikationer
**
Du har avlagt examen på avancerad nivå inom medicinsk teknik, elektroteknik, maskininlärning, statistik, datavetenskap, eller ett relaterat område som bedöms vara relevant för projektets forskningsinriktning, eller slutfört kurser om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inom ovan nämnda områden eller på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.
Särskild behörighet till utbildning på forskarnivå inom Medicinteknisk vetenskap har den som fullgjort kursfordringar om minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inom ett område relevant för forskarutbildningsämnet. Den sökande ska också kunna uppvisa dokumenterade kunskaper i engelska.
Du har kunskap och expertis inom datorseende och/eller medicinsk bildbehandling, deep learning och matematik. Du har kunskap inom programmering, speciellt Python.
Du är självgående, noggrann och arbetar effektivt. För denna anställning är god kommunikationsförmåga viktig: Du trivs med att delta aktivt i möten och har lätt för att uttrycka dig muntligt samt föra resonemang och diskutera frågor tillsammans med andra.
Din arbetsplats
Linköpings universitet är en av de ledande AI-institutionerna i Sverige. Vi har starka kopplingar till framstående nationella forskningsinitiativ, som DDLS, WASP och ELLIIT och du kommer att ha tillgång till toppmodern datorinfrastruktur för maskininlärning, t.ex. genom BerzeLiUs men även via kraftfulla lokala datorer.
Du kommer att arbeta på avdelningen för medicinsk teknik IMT, som forskar inom många projekt som kombinerar medicin och teknik. Tjänsten är inom en forskargrupp som utvecklar metoder för medicinska bilder. Forskargruppen samarbetar med flera läkare vid Universitetssjukhuset i Linköping, genom CMIV. Forskargruppen samarbetar även med andra avdelningar på LiU; främst avdelningen för datorseende vid institutionen för elektroteknik (fokus på deep learning för datorseende), och avdelningen för statistik och maskininlärning vid institutionen för datavetenskap (fokus på teorin bakom maskininlärning).
Om anställningen
I samband med tillträde till anställningen kommer du att antas till forskarutbildningen i Medicinteknisk vetenskap. Läs mer om respektive fakultets forskarutbildning här.
Anställningen är tidsbegränsad till normalt fyra år heltid. Förlängning av anställning upp till fem år sker utifrån grad av undervisnings- och institutionsuppdrag. Vid särskilda skäl kan ytterligare förlängning ske. Du anställs till en början på ett år, och därefter förnyas anställningen med högst två år i taget, utifrån uppnådd studieplan.
Tillträde snarast eller efter överenskommelse.
Lön och förmåner
Doktorandlönen regleras utifrån en lokalt avtalad lönestege.
Begynnelselönen är 36400 sek (revideras årligen den 1 oktober).
Läs mer om förmåner för anställda här.
**Fackliga kontaktpersoner
**
Information om fackliga kontaktpersoner, se Hjälp för sökande.
**Ansökan
**
Du söker denna anställning genom att klicka på knappen ”Ansök” nedan. Din ansökan ska vara Linköpings universitet tillhanda senast 2025-05-15. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag beaktas inte.
Discussion in the ATmosphere